Тест крви потврђен за више од педесет врста рака

позадини

Болести рака су водећи узроци смрти широм света и тај тренд је у порасту. Поред потенцијалног смањења морталитета, побољшање скрининга на нивоу популације такође смањује морбидитет од болести и лечења, повећава вероватноћу успеха лечења, побољшава квалитет живота и смањује трошкове и сложеност лечења.

У САД је тренутно доступно само пет скрининг тестова за рак дојке, дебелог црева, грлића материце, плућа и простате. Ови скрининг тестови смањују морталитет специфичан за рак, али су повезани са високим стопама лажно позитивних, прекомерном дијагнозом и прекомерним лечењем, разликама у придржавању, ниском позитивном предиктивном вредношћу (позитивна предиктивна вредност [ППВ] дефинисана као пропорција истинито позитивних и позитивних резултата теста) и висока кумулативна стопа лажних позитивних резултата када се користи узастопно.

Такозвани тест раног откривања више карцинома (МЦЕД), намењен да допуни постојеће скрининг тестове, могао би повећати број карцинома откривених скринингом на нивоу популације и потенцијално побољшати клиничке исходе. То је нови приступ који детектује сигнале за више врста рака из деоксирибонуклеинске киселине без ћелија (цфДНК) или других аналита добијених из тумора који циркулишу у крви.

У студији циркулишућег атласа генома без ћелија (ЦЦГА), проспективна, опсервациона студија са контролисаним случајевима, МЦЕД тест, у коме се цфДНК секвенцира из узорка крви, у комбинацији са машинским учењем, успео је да открије сигнале рака од неколико врсте карцинома и одредити порекло сигнала рака (канцер сигнал оригин [ЦСО]) могу се одредити са великом тачношћу.

објективан

Циљ актуелне публикације [1] др. Трећа и последња ЦЦГА подстудија коју је представио Ериц А. Клеин са Гликман Института за урологију и бубреге на Кливлендској клиници у Кливленду, САД, и колеге је била да се валидира МЦЕД испитивање које је даље усавршено за употребу као алат за скрининг.

методологија

ЦЦГА студија је била проспективна, мултицентрична, опсервациона студија са контролом случаја са лонгитудиналним праћењем. Између августа 2016. и фебруара 2019., 15.254 учесника, укључујући 8.584 са раком и 6.670 без рака, присуствовало је 142 америчка места.

ЦЦГА је укључивао три унапред дефинисане под-студије: 1) одређивање обрасца метилације цфДНК специфичног за сваки тумор, 2) оптимизацију теста и 3) клиничку валидацију у оквиру независног скупа података за валидацију.

Унапред одређена трећа под-студија која је овде представљена укључивала је учеснике старости најмање двадесет година. Рука против рака укључивала је субјекте којима је дијагностикован рак и/или су заказани да се подвргну биопсији и/или хируршкој ресекцији због познатог или веома сумњивог малигнитета. У другој групи истраживања укључени су субјекти без рака. Статус без рака потврђен је током прве године накнадне посете.

Да би пристрасност свели на минимум, научници су рандомизирали узорке крви узетих једном за анализе.Они су прикупљали клиничке, патолошке и радиолошке податке годишње укупно пет година путем упитника учесника и медицинске документације, укључујући извештаје о нежељеним догађајима повезаним са прикупљањем крви за студију.

Користећи новоразвијени софтвер, узорци су класификовани на основу регионалних образаца метилације. Они би се могли препознати као слични одређеној класи рака, али би се такође могли доделити неколико класа рака. Посебан модул је такође коришћен за одређивање статуса карцинома у односу на статус без рака и ЦСО.

Главни циљеви ове под-студије били су да се процени учинак теста за откривање сигнала рака, предвиђање ЦСО и комбинација ова два. Научници су утврдили специфичност (пропорција учесника са негативним резултатом теста међу учесницима без рака), осетљивост (пропорција учесника са позитивним резултатом теста међу свим учесницима рака у сету анализе) и тачност предвиђања за ОЦД (пропорција учесника). са тачно предвиђеним резултатом).ЦСО међу истинито позитивним учесницима, искључујући оне код којих је ОЦД била непозната.

Секундарни циљеви су укључивали а) перформансе тестова по старосној групи, б) перформансе теста за откривање сигнала рака методом дијагнозе рака (скрининг тест за рак дојке, грлића материце, колоректалног карцинома, плућа и простате или клиничка презентација) и ц) перформансе теста за откривање сигнала рака у унапред дефинисаној групи.

Резултати

Укупно 5.309 учесника (3.237 са раком и 2.069 без рака, 3 без статуса болести при уласку у студију) било је уписано у ову трећу потстудију валидације ЦЦГА. Подаци од 4.077 учесника (2.823 са потврђеним раком и 1.254 без рака) укључени су у скуп анализе.

Демографија учесника и основне карактеристике биле су упоредиве између група, са очекиваним разликама у старосној дистрибуцији између оних са и без рака: било је више људи са него без рака у старијим старосним групама.

Просечна старост (СД) била је 60,6 година, 55,4% учесника (2.258/4.077) су биле жене (са већим процентом у групи без у поређењу са групом са раком) и 81,2% учесника (3.312/4.077) је било класификовани као белци који нису латиноамерички. Фаза И или ИИ болести била је присутна код 54,9% учесника са раком (1.552/2.823).

Специфичност за откривање сигнала рака била је 99,5% (95% интервал поверења [ЦИ] 99,0% до 99,8%). Укупна осетљивост за откривање сигнала рака у различитим класама и стадијумима рака била је 51,5% (49,6% до 53,3%).

Осетљивост се повећала са стадијумом И (фаза И: 16,8% [14,5% до 19,5%], фаза ИИ: 40,4% [36,8% до 44,1%], фаза ИИИ: 77,0% [73,4% до 80,3%], фаза ИВ: 90,1 % [87,5% до 92,2%]).

Осетљивост стадијума И-ИИИ била је 67,6% (64,4% до 70,6%) за дванаест унапред дефинисаних карцинома, што је чинило приближно две трећине годишњих смртних случајева од рака у Сједињеним Државама. Осетљивост за све врсте рака била је 40,7% (38,7% до 42,9%). Сигнали рака су идентификовани за више од педесет врста рака.

Укупна тачност предвиђања ОЦД у истинито позитивним исходима била је 88,7% (87,0% до 90,2%). Специфичност, осетљивост и тачност предвиђања ОЦД су показали сличне резултате у свим старосним групама (<50 година, ≧50 година, ≧65 година).

Приликом процене перформанси теста методом дијагнозе карцинома, укупна осетљивост је била већа (63,9% [61,8% до 66,0%)] за канцере идентификоване клиничком презентацијом него за карциноме идентификоване скрининг тестовима (18,0% [15,5% до 20,8%] ]), вероватно због превласти раног стадијума рака простате и дојке у скрининг тестовима.

Закључак

У овој унапред специфицираној подстудији клиничке валидације великог обима, МЦЕД тест је показао високу специфичност и тачност предвиђања ОЦД. Сигнали рака су препознати за различите типове рака. Ниска стопа лажних позитивних резултата од 0,5% сугерише да тест може ограничити додатну штету због непотребних дијагностичких процедура у клиничкој рутини. Резултати подржавају изводљивост овог МЦЕД теста заснованог на крви као додатка постојећим скрининг тестовима за појединачне врсте рака.

Ограничење ове студије било је да би узорци крви узетих од пацијената са раком након што су били биопсирани могли да садрже цфДНК из тумора. Још једно ограничење ЦЦГА студије било је то што, као студија случај-контрола, није одражавала учинак скрининг студије.

Тренутно је у току већи програм клиничког развоја са даљим студијама за процену перформанси теста и/или клиничке корисности у циљним популацијама (СТРИВЕ, НЦТ03085888; ГИПФЕЛ, НЦТ03934866; ПАТХФИНДЕР, НЦТ04241796). У ПАТХФИНДЕР студији, клиничка примена (нпр. време до постизања дијагностичког решења) и безбедност се посебно вреднују.

ЦЦГА студија је регистрована код ЦлиницалТриалс.гов под бројем НЦТ02889978. Рад је финансијски подржао Граил, Инц.

!-- GDPR -->